Le marathon du Massachusetts se transforme en scène de crime quand plusieurs participants sont retrouvés étendus sur le sol, une balle dans le flanc. Jane et Maura, qui participent à la course, doivent mener l’enquête le plus discrètement possible afin d’éviter tout mouvement de panique.
Une affaire de meurtre commis en 1995 sur un fugueur non-identifié est rouverte lorsque le frère de ce dernier présente des preuves de son identité.
Tandis que Peter, promu, s'installe dans son nouveau poste au FBI, Neal doit mener à bien un cambriolage de musée audacieux sous le nez du FBI.
Peter assigne à Neal un nouveau contrôleur pour enquêter sur un marché noir en ligne, mais la loyauté de Neal va être mise à l'épreuve lorsqu'il découvre que la piste risque de mener à Mozzie.
Danny et Baez enquêtent sur l’agression d’un boxeur par une bande qui s’en prend à des sportifs célèbres. A cette occasion, ils doivent enquêter avec Jimmy Mosley, l’ex-amant de Maria, ce que Danny ne voit pas d’un très bon œil. Frank apprend qu’un policier qui a commis une bavure il y a des années demande à être promu au rang de sergent.