All'inizio della stagione, un nuovo branco di Alfa arriva a sconvolgere la vita di Scott, mentre Derek e Isaac tentano di localizzare Erica e Boyd.
Allison e Lydia trovano un possibile indizio per localizzare Boyd ed Erica, mentre un amico di infanza di Stiles scompare.
Con Boyd e Cora a piede libero e sotto l'influenza della luna pena, Scott e Derek devono chiedere aiuto a un alleato inaspettato.
Sotto consiglio di Deaton, Scott e i suoi amici usano un rituale antico ma estremamente pericoloso che li aiuti a salvare le persone che amano e a fermare Deucalion dal raggiungere il suo scopo.
Mentre il pericolo si avvicina a Scott, minacciando il suo fidato mentore e capo, Deaton, Kali e i Gemelli inseguono Derek.