Il terrorista che aveva precedentemente tenuto in ostaggio parte della squadra ritorna con un piano per attaccare il Presidente.
La squadra dell'NCIS viene chiamata a indagare quando un corpo vestito da tenente della Marina viene scoperto apparentemente stuprato e ucciso.
Quando il corpo di un marine ucciso viene trovato nella foresta, le indagini conducono alla milizia locale e a un traffico di armi andato storto.
La squadra dell'NCIS indaga quando il corpo di un ufficiale navale scomparso da due anni compare in fondo a un lago.
Quando un sottufficiale viene brutalmente freddato sull'autostrada, Gibbs e la squadra scoprono che l'ufficiale conduceva una doppia vita.