Halloween è pieno di soprese per i dottori. Alex riceve una visita inaspettata da una ex paziente. Meredith si sente perseguitata dalle ceneri della madre. Un chirurgo che Cristina ammira la snobba.
Nell’episodio numero 100, la serie torna indietro otto anni per mostrare il primo incontro tra Jane e Teresa Lisbon, e il primo caso su cui hanno indagato insieme al team del CBI.
Michael cerca di tenere insieme il gruppo dopo che uno di loro li ha traditi mentre T-Bag trova un altro partner che ricatta Gretchen per trovare un compratore per Scilla.
Nel deserto di Las Vegas vengono ritrovati dei corpi affogati misteriosamente, e la squadra cerca di capire la vera causa e il movente degli omicidi.
J.D. e Kim iniziano a pensare al loro futuro e a quello del loro bebè. Turk porta Carla all'ospedale in tutta fretta dopo che la moglie entra in travaglio. Jordan accusa il dottor Cox di non essere un padre responsabile nei confronti di Jack.