Jane richiede il rilascio di Erica Flynn quando lei afferma di avere informazioni necessarie al CBI per condurre le loro indagini su un omicidio.
Nel finale di stagione, l'unità di intelligence diventa una famiglia a tutti gli effetti.
L'intelligence è pronta a entrare in azione quando un lavoro sotto copertura si trasforma in una caccia all'uomo per due fratelli. Voight viene interrogato per l'omicidio di Jin della precendente stagione.
Un caso colpisce l'unità da vicino, quando l'intelligence si occupa di una sparatoria tra gang che ha un solo testimone: la figlia di Olinsky.
Mentre il caos regna alla conferenza sull'energia, Michael è costretto a fare una scelta.