Prentiss e Reid restano prigionieri all'interno della sede di una setta, quando vi si recano sotto copertura per indagare su potenziali abusi su dei bambini.
Juliet è costretta a effettuare un'appendicectomia d'emergenza su Jack, mentre si scopre il rapporto che c'è stato dopo il soccorso tra Jack e Kate. Intanto Sawyer, Claire e Aaron si dirigono all'accampamento di Jack con Miles.
Locke, Ben e Hurley continuano a cercare il capanno, perché Locke possa parlare con Jacob. Sulla nave, Keamy si prepara a un assalto totale all'isola.
Durante il volo in elicottero verso la nave, la coscienza di Desmond vaga avanti e indietro tra il 2004, e il 1996. È costretto a cercare Daniel Faraday nel 1996 per trovare le risposte che gli servono per fermare questi sbalzi temporali.
Ben, Locke e Hurley salgono alla stazione Orchidea, dove trovano ad aspettarli Keamy e i suoi uomini; Jack e Kate vanno a cercare l'elicottero, e più tardi si unisce a loro anche Sawyer. Prima parte.
