Halloween è pieno di soprese per i dottori. Alex riceve una visita inaspettata da una ex paziente. Meredith si sente perseguitata dalle ceneri della madre. Un chirurgo che Cristina ammira la snobba.
Con una nuova sede in una missione di Los Angeles, l'Ufficio Progetti Speciali (UPS) dell'NCIS dà il benvenuto a Callen nella squadra e corre a risolvere un rapimento.
Quando affiora il cadavere del trafficante d'armi La Grenouille, la squadra dell'NCIS viene messa sotto indagine dall'FBI e Jenny Shepard diventa la principale sospettata.
Il fato dell'intera squadra è appeso a un filo mentre danno la caccia all'assassino di uno dei loro.
Jimmy Palmer diviene l'obiettivo di un misterioso assassino che solo lui può riconoscere.