シーズン2、エピソード3: マクガイバーとジャックは新しい任務を受ける。新しく仲間となったサマンサが大物戦犯を尋問し、テロ攻撃に関する情報を得たのだ。どうやら「赤い拳」なるテロ集団がダイヤ強盗を繰り返しているらしい。連中の目的は盗んだダイヤで大量破壊兵器を購入し、大規模テロを引き起こすこと。ダイヤの隠し場所を掴んだ一同はテロ攻撃を未然に防ぐべく、ダイヤを盗む作戦に出る。