シーズン1、エピソード1: 第一話: 終戦後間もない昭和21年夏、戦地から帰還した金田一耕助は、戦友である鬼頭千万太の遺言により、彼の三人の妹に迫る危険を防ぐため、瀬戸内海の孤島・獄門島へ向かう。千万太の家である本鬼頭は代々島随一の網元で、そこでは千万太の従姉妹である早苗が、島の実力者である千光寺の了然和尚、鍼医師の村瀬幸庵、村長の荒木真喜平の協力を得て留守を守っていた。しかし、獄門島では本鬼頭と分家の分鬼頭の争いが絶えず、分鬼頭の実権を握るお志穂は美少年・鵜飼章三を千万太の妹たちに近づけ、何かを企んでいた。そんな中、千万太の通夜の晩、三姉妹の一番下の花子の死体が常識を超えた無惨な姿で発見される。
