ムサシ少年は、嵐の明けた朝にウルトラマンコスモスに遭遇する。バルタン星人との戦いで傷ついたコスモスをムサシは助けるが、そのことを誰も信じてくれず寂しい気持ちになっていた。そんなとき、大怪獣･呑龍が遺跡公園に出現。そして、呑龍の背中からバルタン星人が現れた!