1536年、スコットランド。ハイランダー一族のコナーは、自分が首をはねられない限り死ぬことはない不死の一族であり、究極の宝を求めて戦う運命にあることを知る。時はたち現代のニューヨーク。コナーら戦士たちの最終決戦“集合の時”が迫っていた。