国民的アニメ『忍たま乱太郎』が、大人も子供も楽しめる本格忍者アクションエンターテイメントとして三池崇史監督により実写化！時は戦国時代。主人公は忍者のたまご、乱太郎。先祖代々、ヒラ忍者の家系に生まれた乱太郎は、エリート忍者めざして忍者の学校＜忍術学園＞に入学。だけどクラス分けされたのは、残念ながら成績はいまいちの「一年は組」・・・！ 個性豊かな仲間たちといっしょに、毎日、勉強に励むのだが、なぜか追試や補習ばかり。そんなある日、忍たまの仲間が暗殺者に狙われる羽目に・・・。仲間を助けるには、プロの敵忍者たちと勝負しなければならない。その方法は、足の速い乱太郎にはもってこいの勝負だったのだが・・・！