幸せな日々を送るグルーたちのもとに新たな家族、グルーJr.が超爆誕。 一方その頃、家族をねらうグルー因縁の超宿敵。 グルー＆ルーシーと三姉妹のマーゴ、イディス、アグネスは身分を隠し新たな町で超奮闘。 そして最強最悪のボスに仕えることが生きがいのミニオンたちは超特訓⁉ 敵はグルーの"過去"からやってきた。新たな一員が加わったグルーファミリーに危機が迫るとき、スーパーパワーを手に入れたメガミニオンが立ち上がる！