アナベス・ギッシュ

サンディエゴ支局の捜査官が、BAUに協力を依頼。長年追っていた投資詐欺師が、フロリダで詐欺のターゲットを殺したという。犯人はいくつもの偽名を使い分け、同時に複数の詐欺を働いており、偽名をコントロールしきれず精神に破綻をきたしているらしい。

女子大生ジョイ、男子学生ジャスティンとセスがERへ。恋人ヴァネッサによると、ジョイはセスに性的暴行を受け、ジャスティンが助けたという。ところが真実は違っていた。

スカリーが意識不明に陥り、恐るべき事態が起きる幻覚を見る。彼女はその幻覚が、息子ウィリアムが伝えてきた未来の出来事だと知り、それが起きるのを防ぐため、モルダーにスモーキング･マンを探すよう訴える。また、モルダーの異母弟ジェフリーは謎の集団に襲われ、彼らがウィリアムを捜していることを知り、スカリーにそれを伝える。一方、モルダーは尾行車を逆に追跡し、スモーキング･マンとは別の新たな陰謀組織の存在を知る。

男性がホテルの1室で睾丸を切断されるという事件が発生し、SVUが出動する。部屋を予約した女性ジュリーは関与を否定するが、事件当夜のホテルの監視映像に映っているのをカリシが発見。調べを進めるとジュリーは犯行時刻の直前にホテルの近くで女性2人と食事をしていた。3人はかつて同じ高校で同じクラブに所属しており、その担当教師が被害男性のジェイソンだった。SVUは口を閉ざす3人を公務執行妨害で逮捕し…。

スカリーがネット･ニュースに世界規模の陰謀の情報を流したことから、カーシュ長官はXファイル課の閉鎖を宣言。そんな状況下で、モルダーとスカリーは息子ウィリアムを守ろうと彼の行方を追うが、スモーキング･マンも、そして謎の組織も彼を追っていた。モルダーはスモーキング･マンの部下レイエスの情報により、謎の組織のリーダー、ミスターYと対決。ついにウィリアムと対面するが、追手がすぐそこまで迫っていた…。