父を殺した人間との共同生活に不安を隠せない美兎。BABELへの入学を翌日に控える晩、彼女は寝入る暁月の枕元に立った。様々な想いが胸を駆ける中、彼女は決意を新たにする-見極めるよ、キミを。キミの傍で-。だが、その瞬間、美兎は寝ぼけた暁月にベッドに押し倒されてしまう。服を脱がされつつも、時計の一撃で何とかピンチを脱する美兎であった…。翌日、正体不明の頭痛に悩まされながら登校する暁月と美兎。暁月は、転校生は空いてる席に座るものだと勝手に着席するが、逆上した席の主・鬼塚に襲いかかられてしまう。これをあっさりと返り討ちにする暁月であったが、騒ぎを聞きつけた風紀委員が現れ…。

何者かにプログラムを書き換えられ、制御不能となった戦闘訓練用コカトリスに石化させられてしまった葛葉と千影、そして二人をかばい必死に戦う美兎の前に暁月が現れる。7つのADで巨大な剣を具現化した暁月は、最高レベルに設定されたコカトリスすら簡単に倒してしまうのであった。だが、千影や葛葉、石化されていた生徒たちが元の姿にもどっていく中、一人、プログラムルームのマスターキーを手に焼却炉へと向かう人影があった。まさにマスターキーが捨てられそうになったそのとき、全てを予見していたかのように暁月が現れる。マスターキーを持っていた人物、それは…。

暁月に握手を求めておきながら殴りかかってきた男は、海堂元春と名乗った。高等部Aクラスの万年落ちこぼれと称する海堂は、意味深な言葉をつぶやくと、会わせたい人物がいるから次の月曜日に付き合えと一方的に約束をしていくのであった。その晩、美兎と共にコンビニで買い物をしていた暁月は、美兎のサイズに合った下着や服がない事実を知る。美兎は暁月の妹の服や下着を借りていたのだが、スタイルの合わない服を無理に着ていたのだった。翌日、さっそくショッピングモールへと訪れる二人。葛葉、千影の助けも借りついに下着を取り扱うお店にたどり着くが…。