河合井コタローは中学2年生。子供のころに作ったスライムに命が宿り、「ぷにる」と名づけ仲良く過ごしてきた。ところが、7年の月日でぷにるは超絶美少女の姿に成長！ ついドギマギして冷たく接してしまうコタローに、ぷにるは様々な姿に変身して「かわいい」と言わせようとするが…。一方コタローは、憧れの先輩・雲母麻美に、チャラ男なクラスメイト・南波遊助が馴れ馴れしく接近しているのが気に食わない。そこでコタローはぷにるを使った“ある作戦”を思いつく。

誰にでも優しい姿はまるで聖母、学園のマドンナ的存在・雲母麻美。コタローは彼女の気を引くため、ぷにるに「とある姿」に変身するよう頼む。ところが、それを見た雲母先輩の様子がおかしくなって…。そんな中、理科教師の真戸博士はぷにるを自らの野望のための研究材料にしようと密かに目論んでいた。

大好きなキャラクター、キュティちゃんのコラボカフェにやって来たコタロー。キュティちゃんに囲まれて幸せな時間を満喫するはずが、ぷにるに後をつけられていて…。5月5日はこどもの日。南波に誘われ、コタローとぷにるはこどもチャンバラ大会に参加することになった。豪華な景品を狙う猛者たちに立ち向かうぷにる。白熱の勝負の行方は!?

ぷにるにライバル登場!? コタローのクラスメイトの御金賀アリスは、「キュティランド」社の跡取り予定の超・お嬢様。“KAWAII”王座をめぐり火花を散らすぷにるとアリスだが、アリスは自分が作ったキャラクターのルンルーンには命が宿らないため、ぷにるを羨ましく思っていた。ある朝、動きだしたルンルーンに「人間になった！」とはしゃぐアリスだが…。

体育祭の季節。雲母先輩は準備の忙しさ（による子供とのふれあい不足）で元気がない。ぷにるは特別な応援で励まそうとするが…。一方、宝代が連れてきた新しいルンルーンの預け先を巡り、ぷにると南波の真剣勝負が今、始まる！