新主人公登場！ その名は「斬札ウィン」!! デュエマが大好きな彼は、ある日参加した大会で優勝賞品のカードを狙う少年、覚知山ボウイとの戦いに挑む。そこで聞こえてきた謎の声に導かれるままにウィンが召喚したのは、世界の支配を目論む邪神で――!? 新たなデュエル・マスターズが今始まる！

ウィンに呼び出された後、カードの中へと戻っていった邪神。空腹を満たすために再びカードから飛び出すも、なんだか様子がおかしいようで……。一方、ウィンとボウイの不思議なデュエルに魅せられたウィンの父パパリンも早速ウィンと対決することに！ ウィンは生粋のデュエリストであるパパリンに勝利することができるのか!?

若きカリスマIT社長であり、「D4」のリーダーでもある無敗の最強デュエリスト、プリンス・カイザ。彼の圧倒的な強さを知り対決を望むウィンの前に、同じく「D4」の一人であるボウイが現れる。カイザとの対決しか頭にないウィンに対し、新たなカードを手にリベンジに燃えるボウイは再び勝負を申し込む！

珍獣チバカブラは実在した！ ウィンたちが住むチバに潜むという謎の生物チバカブラが持っていたのは、なんとデュエマのカード!? そのカードに興味を持ったウィンと仲間たちで結成された「チバカブラ捜索隊」一行は、チバカブラとカードの正体を探るべく、チバはシラハマの奥地にあるジャングルへ向かうのだった――。

邪神くんが本来の力を取り戻すためには、邪神の一族「アビスロイヤル」の仲間を集める必要があった。ある日、ウィンの友達から漂う魅力的な香りを嗅ぎつけた邪神くんは、その正体を突き止めるためウィンと共に彼らを追いかけることに。邪神くんを惹きつける香りの主は、もしや新たなアビスロイヤルなのかーー!?

プリンス・カイザへの挑戦権をかけた大会「ガチデュエバトル」が開催！ ウィンは邪神くんと共に大会に参加することに。大会当日、いじめられっ子を助ける謎の美少女カレンと出会いなんだかいい雰囲気のウィン。大会も順調に勝ち進む中、ウィンに嫉妬の炎を燃やすうんちくは自慢の墓地利用戦術でウィンに勝負を挑む!!