春風小学校6年生の拳一、浩美、しのぶは機械人の歯車王と部下のギーグに遭遇し、機械化獣マッドシャープに襲われる。その時、三人の前に恐竜のロボットが現れた。恐竜時代にタイムスリップした三人は、地球が「機械化帝国」の侵略を受けていたことを知る。そして光の戦士エルドランから三体の恐竜ロボットを託されて…。
ゴウザウラーで機械化獣を倒した拳一たち。しかし大人たちには、褒められるどころか、学校を壊したことを責められるばかり。その上、防衛隊の武田長官に、ゴウザウラーに乗ることを禁止されてしまう。納得いかない拳一たちは、ゴウザウラーを元の校舎に戻そうと夜の学校に忍び込み、秘密の校舎修理作戦を決行するが…。
放課後、6年2組では「誰がパイロットになるか」について議論していた。そんな中、一人浮かない顔をしている浩美。成り行きでパイロットになったものの、彼は争いごとが嫌いで、できれば機械化帝国とも戦いたくないのだ。一人教室を出た浩美だが、帰り道に洗濯機の機械化獣キラーウォッシャーと鉢合わせてしまい…。
朝寝坊した拳一はスケボーで登校した。チャイムと同時に教室に駆け込むが、なんとそこは高木先生の6年1組。そして、こっぴどく怒られてしまう拳一。給食の時間。機械化獣出現の報が入った。ザウラーズ出動のその時、拳一のことをまだ根に持っていた高木先生が「10分で戻ってこなければ給食を片付ける」と言い放ち…。
明日は日曜日。6年2組も休みに何をして遊ぶかで盛り上がっている。そんな中、クーコとユカ、はるえは暗い顔。日曜日に機械化獣が現れてザウラーズの出動が遅れたらと不安なのだ。翌日、三人は気晴らしにショッピングに出かけることに。だが乗っていたバスが故障し、ギーグに機械化獣バッドバーストにされてしまい…。
日曜日。ゲームセンターに噂の「ゲームの達人」が現れた。対戦した拳一たちは、ものの見事に負けてしまう。それを聞いたしのぶは成り行きで拳一たちのリベンジをすることに。だが、ゲームの達人はしのぶのお婆ちゃんだったのだ。驚いたしのぶは恥ずかしさのあまり、二度とゲームをしないで、とキツく当たってしまうが…。