第1話: ブルターニュ沖に浮かぶペニック島に、突如23人の武装集団が現れる。彼らはジャウェン町長をはじめとする島民全員を学校に集め人質とし、リーダーのアルファは「48時間の監禁」と、島外に異変が伝わらないよう普段通りの生活を続けることを要求する。その頃、カマレの町からペニック島へ戻る連絡船には、看護師のクリス、少年ドリアン、老女マド、少女ケリーら島民4人の他、10年前に事件を起こして島を去ったアレックスが乗り合わせていた。しかし、島に近づいた連絡船は武装集団の銃撃を受け、船長が即死、船は航行不能となり炎上してしまう。

第2話: “嵐の海”作戦を決行しようとする武装集団によって、老父アルベールが殺された。その事実を知った島民たちが身を寄せ合う学校内では、極度の不安と緊張感で張り詰めた空気が漂っていた。同時刻、難を逃れたクリスたちは、空き家になっていたアレックスの父の家に身を潜める。その後、島に郵便船が来たことに気づき、島外に住む憲兵隊でもあるドリアンの父に助けを求める手紙を出そうと考える。病を患っているマドが体調を崩し、クリスは薬をとりに自宅に戻る。

第3話: クリスの企みは武装集団によって潰され、拘束されてしまう。その後、人質として学校内に連れて来られたクリスは、息子ジョフロワと再会できたものの、島民の中に武装集団に情報を流す裏切り者がいることを言及。しかし町長には激昂され、逆に島民の間に疑心暗鬼を広げる結果となってしまう。一方、違和感のある手紙を息子ドリアンから受け取った父で憲兵隊のロドルフは、誕生日プレゼントを直接手渡すべく、ペニック島へ向かう。

第4話: 武装集団の追跡をかわし、殺されたアルベールの家に逃げ込んだアレックス、マド、ケリー。外に放置されたままのアルベールの遺体を見かね、その亡骸を埋めるため墓を掘り3人で弔った。その後、羊飼いの愛犬ゾークの首輪に隠したメモでやり取りをする元恋人キャンディスからのメモを確認するため、アレックスは牧場へ。そして家に戻った彼は、ケリーからアルベールの家に大量の銃が隠されていたことを知らされる。武装集団へ反撃するため、待望の武器を手に入れた彼らは、ある計画を企てるのだった。その後、キャンディスのメモの指示通り、人目を避けながら墓地へと向かったアレックス。しかし彼の前に現れたのは、かつての親友で今はキャンディスの恋人であるヤニックだった。

第5話: ヤニックの策略により、武装集団に捕まったアレックス。彼が連行されたことで、情報を流す裏切り者がヤニックだったことが島民にも知れ渡る。そんな中、10年ぶりに町長と向き合うアレックスは、“父を見殺しにした”と罵るも、町長から身の潔白を訴えられ、ヤニックから聞いていた話との食い違いに言葉を失ってしまう。一方、ヤニックの裏切りにショックを受けるキャンディスだったが、彼女自身もまた、武装集団の協力者ではないかと島民に疑われ孤立していた。その後、武装集団への参加の理由をヤニックに問いただし、彼の理念に理解を示すと、“嵐の海”作戦の計画を確かめるため、2人はある場所へ向かう。

第6話: マドが命を賭けて放った希望の炎は、突如降り出した雨によって消されてしまいました。島民たちは落胆しましたが、秘密裏に武器を手にし、武装集団に対する反撃の機会をうかがっていました。一方で、孤独ながらも奮闘を続けるケリーは、島の外へ異常を知らせるため救難信号を送ります。