世界平和を脅かす謎の組織「Q」。 その野望を阻止すべく、各分野の精鋭11名が集い、防衛組織「マイティジャック」が極秘に結成された。 彼らは科学の粋を集めて作られた万能戦艦マイティ号を駆り、空、海、地中とあらゆる場所でQが引き起こす世界的な陰謀や難事件に挑む。 人知れず繰り広げられる、MJとQの熾烈な戦いの行方は…？