トラブル・コントラクター（厄介ごと請負人）のケインは、広域犯罪組織デュゴール・コネクションが開催しているシークレットオークションから盗品の奪還を依頼される。本拠地の人工惑星に侵入したケインは、別のルートからデュゴール・コネクションを捜査していた探偵ミリィと出会うが…。

機体整備のため宇宙ドックに立ち寄ったケインの船ソードブレイカーに、「腐れ縁」の星間警察レイル警部から緊急連絡が入る。それは暴走したフェイズドライブの実験艦を止めてほしいという依頼だった。このままだと宇宙ドックに衝突!? しかも依頼料はタダというのだが…。

押しかけ乗員となったミリィは料理は得意だが、なぜか厨房施設をそのたび破壊してしまう。さらにレイルからの海賊絡みの裁判の仕事を勝手に引き受けてしまい、ケインとミリィは言い争いになってしまう。怒ったミリィは一人で証人の少女の護送に出かけてしまうのだが…。

ミリィの「栄光のミスコン百回参加」を達成するために、『ミスヤシガニコンテスト』が開かれる海洋惑星サンザニアに向かうことになったケインたち。予選を勝ち抜き、決勝に進んだミリィだが、その夜、泊まってる水上コテージをナイトメアの刺客が襲ってくる…!!

相変わらずミリィは厨房を破壊し続けたりしたため、お財布の中身が厳しくなってきたケインは、兵器工場惑星ロイデストの巡回警備する、簡単な仕事を受けることにした。だが止まっているはずの警備システムが動き、警備システムの管理する機械衛星ドルキバが落下し始めてしまった…！