トラブル・コントラクター（厄介ごと請負人）のケインは、広域犯罪組織デュゴール・コネクションが開催しているシークレットオークションから盗品の奪還を依頼される。本拠地の人工惑星に侵入したケインは、別のルートからデュゴール・コネクションを捜査していた探偵ミリィと出会うが…。

機体整備のため宇宙ドックに立ち寄ったケインの船ソードブレイカーに、「腐れ縁」の星間警察レイル警部から緊急連絡が入る。それは暴走したフェイズドライブの実験艦を止めてほしいという依頼だった。このままだと宇宙ドックに衝突!? しかも依頼料はタダというのだが…。

押しかけ乗員となったミリィは料理は得意だが、なぜか厨房施設をそのたび破壊してしまう。さらにレイルからの海賊絡みの裁判の仕事を勝手に引き受けてしまい、ケインとミリィは言い争いになってしまう。怒ったミリィは一人で証人の少女の護送に出かけてしまうのだが…。

相変わらずミリィは厨房を破壊し続けたりしたため、お財布の中身が厳しくなってきたケインは、兵器工場惑星ロイデストの巡回警備する、簡単な仕事を受けることにした。だが止まっているはずの警備システムが動き、警備システムの管理する機械衛星ドルキバが落下し始めてしまった…！

宇宙軍所属の看護婦養成船ハイボールから、生徒たちの身辺養護の依頼が入る。女性だけの船であるのと、卒業演習が近い生徒たちへの影響も考慮し、警護員は女性限定という。キャナルの立体映像装置が故障のため、ミリィと女装したケインが新任の栄養士として乗り込むことになるが…。

連絡を断った考古学者を捜し出すという依頼を受けたケイン。捜索はキャナルとケイン＆ミリィチームに分かれて始められた。すると行方不明の考古学者は、犯罪帝国ナイトメアが進めていたロストシップの発掘に立ち会っていたらしい。その秘密を守るため戦闘チームがケインたちに襲い掛かるが…。