荒木剛太 (藤ヶ谷太輔) は、荒れた生徒を力による恐怖で制圧することを許された特別教師“仮面ティーチャー”である。剛太の新しい赴任先は、華空学院高校。初日とあって空回り気味の剛太だったが、英語教師･美樹 (大政絢) と出会い、幸先の良さに顔がほころぶ。そんな剛太を待っていたのは、問題児ばかりが集められた2年C組。2年C組はM4 (エムフォー) と呼ばれる、獅子丸 (岸優太)、ボン (京本大我)、コータロー (前田公輝)、リョータ (栁俊太郎) と、彼らを束ねる最強リーダー･金造 (菊池風磨) によって牛耳られていた。案の定、剛太は初日からボコボコにされるが、なぜか反撃しようとしない。そんな中、ボンが金を賭けて友人同士を殴り合わせる「デスマッチイベント」を開催すると知った剛太は―。

剛太 (藤ヶ谷太輔) は、M4の一人･ボン (京本大我) と接したことで、暴力ではない力で学校を変えると決意を新たにする。一方、仮面ティーチャーが登場したことで、校内は騒然。教師たちはM4ら問題児が一掃されるのではと、その存在に期待を寄せる。その状況に苛立ちを隠せないコータロー (前田公輝) は、手下の集団･マッドマックスに指示し、「仮面ティーチャー狩り」に乗り出した。だが、コータローの恐怖と力でねじ伏せるやり方に嫌気が差したマッドマックスは、命令に対して反逆を始める。さらに、金造 (菊池風磨) に制止されたことで頭に血が上ったコータローは、仮面ティーチャーをおびき出すべく美樹 (大政絢) を狙うが…。

体を張ってリョータ (栁俊太郎) を救った剛太 (藤ヶ谷太輔)。美樹 (大政絢) は感心しきりだが、剛太はかつて救えなかった生徒･小林翔平 (神永圭佑) のことを思い苦悩する。学校では、仮面ティーチャーの活躍に称賛の声が高まっていた。一方で、金造 (菊池風磨) は M4のメンバーが仮面ティーチャーに牙を抜かれたと憤慨。獅子丸 (岸優太) は、金造のために「仮面ティーチャーが誰か名乗り出るまで毎晩一人ずつ教師を狩る」と宣言する。金造と獅子丸が頑なに大人に屈しない背景には、秘められた過去があった。ある夜、教師を狙う獅子丸を仮面ティーチャーとなった剛太が制止する。だが、そこに黒い仮面ティーチャーが現れて…。

獅子丸 (岸優太) を傷つけられたことに激怒した金造 (菊池風磨) が、仮面ティーチャーを捜して男性教師を襲い始めた。金造の暴走を食い止めようとする剛太 (藤ヶ谷太輔) の前に、またも黒い仮面ティーチャーが現れる。憎悪を力に変える金造の攻撃を、圧倒的なパワーで打ちのめす黒い仮面ティーチャー。だが、さらに追い打ちをかけようとしたその時、銀の仮面ティーチャーが黒い仮面ティーチャーの前に立ちはだかり…。剛太は校長の菅原 (志賀廣太郎) に、もう一人の仮面ティーチャーの解任を要求。そんな中、金造がバイト先の建設現場で金を盗んだという連絡を受けた剛太は、金造の元へ急ぐ。