主人公の北神未海は、武蔵野森山学園高校2年6組のクラス委員長。クラスメイトからは美人で優しくしっかり者の委員長として憧れの存在。が、さらなるパーフェクトなモテ子『めちゃモテ委員長』を目指して日々努力中！ そんな未海のクラスメイトにめちゃめちゃモテてる3人組、通称『MM3』と呼ばれるメンズが…。

金髪小麦肌ギャルのクラスメイト坂下リカのプリンセスローズクラブの入部を賭けて、プリクラのリーダー姫野華恋と勝負することになった未海。しかし肝心のリカは面倒を嫌い中々モテ子になる努力をしようとしない。そんなリカに未海は、かなりハードな「めちゃモテ☆ミラクルチェンジ大作戦」を提示する！

クラスメイトの春井香穂が何日も学校を休んでいる。クラス代表として未海が様子を見に行くと誰にも会いたくないという。訳を聞くと、春井は大好きなメル友の男の子に「写りのいい写真」を送ってしまい、会いたいのに会えないでいるという。会うとニキビ肌がばれてしまうことにひどく悩んでいるのだった…。

チョコレートが大好きな佐野杏樹らと一緒にスウィーツを囲む未海。すると甘いものが大好きなMM3の南雲波人が輪に入ってきた。波人と接する杏樹の幸せそうな笑顔を見た未海は、杏樹が波人に恋をしていることに気づく。杏樹の恋を応援しようと、ことあるごとに未海は二人に用事を頼みキッカケ作りをする…。

MM3の東條潮に恋心を抱き始めた未海。そんな矢先に潮の初恋の人、雪下亜莉沙が森山学園に編入してきた。絵に描いたような極上モテ子の亜莉沙に未海は胸のざわつきを覚える。仲の良い二人の様子を見るにつけ胸がズキズキと痛むが、自分の気持ちに鈍感な未海は恋わずらいには気がつかないのだった。

亜莉沙に恋の相談を受け背中を押してあげる未海。しかしその恋の相手は潮だった。かつて味わったことのない胸の痛みを感じる未海だが、告白に行く亜莉沙を見守るしかなかった。翌朝、亜莉沙から告白がうまくいったことを告げられる未海。ショックを受けるが、自分の気持ちに気がついていない未海は…。