春日珠紀は、両親の海外転勤を機に祖母の家に呼ばれ一緒に暮らすことになる。珠紀が村に呼ばれた本当の理由は、先祖代々続く「玉依姫」の使命として、鬼斬丸という刀の封印をすることだった。そこに珠紀を守る宿命を背負った守護者と呼ばれる少年たちが現れ、珠紀は彼らに支えられ、玉依姫としての使命に目覚めていく…。※第14話以降は『緋色の欠片 第二章』です。