伝説のデュエリスト武藤遊戯と、永遠のライバル海馬瀬人との出会い。そしてデュエルモンスターズの生みの親であるペガサスが開催した“決闘者の王国（デュエリストキングダム）”…。すべのでデュエルの原点がここにある！
エピソード1
戦慄のブルーアイズ・ホワイト・ドラゴン
遊戯の祖父・双六が持つ町レアカード「青眼の白龍」を狙い海馬がデュエルを仕掛けてきた。倒れた祖父に代り遊戯が立ち向かう。
エピソード2
幻想師ノー・フェイスの罠
遊戯の元に届いたビデオ、それはデュエルモンスターズの生みの親ペガサス・J・クロフォードのものだった。千年アイテムを持つペガサスが闇のゲームを仕掛ける。
エピソード3
失われしエクゾディア
遊戯は祖父を救い出すため、ペガサス主催のデュエル大会に臨む。城之内も出場しようとする。彼には出場しなければならない事情があったのだ。
エピソード4
インセクターコンボ
全国大会の優勝者・インセクター羽蛾と遊戯のデュエル。独特な王国でのルールにてこずる遊戯は、羽蛾の昆虫カードに追い込まれていく。
エピソード5
究極完全態グレート・モス
羽蛾の必勝コンボ・グレートモスが炸裂！遊戯は劣勢を跳ね返せるか!? 勝利を手にすることができるのか?!
エピソード6
華麗なるハーピィ・レディ
孔雀舞が現れ、デュエルの相手に城之内を指名。伏せたままでカードがわかる舞に城之内は苦戦する。しかし、失明寸前の妹のため城之内は負けられない!
ダン・グリーン
エリック・スチュアート
エイミー・バーンバウム
Frank Frankson
テッド・ルイス
ダレン・ダンスタン
ウェイン・グレイソン
タラ・サンズ
リサ・オルティス
杉島邦久
武上純希
