財務省に勤める上羽鴨（松下奈緒）は、京都の老舗旅館「上羽や」の一人娘だが、京都や老舗旅館独特の風習や作法を嫌い、東大進学で上京して以来、一度も京都には帰っていない。一方、京都の外資系コンサル会社「ワイズ・コンサルティング」では、「上羽や」の買収が進まないことにしびれを切らし、買収のプロ・衣川周平（椎名桔平）を動かす。「上羽や」に偵察に来た衣川は、心筋梗塞で倒れた女将の上羽薫（市毛良枝）が救急車で搬送されるのを目撃し、買収成功を確信する。薫の訃報を受けた鴨は10年ぶりに京都へ帰った。鴨が涙も流さず淡々と葬儀を進める中、仲居頭の塩見鞠子（かたせ梨乃）ら従業員たちは、薫の死を悲しみながらも「上羽や」を守り続ける決意を固める。葬儀が終わり、東京へ戻ろうとしていた鴨に衣川が声をかけてきた。衣川は、自分に任せてくれれば「上羽や」の多額の借金をすべてチャラにすると持ちかける。返事を保留にし、東京へ戻った鴨は、友人から評価額が上がるまで「上羽や」を経営するのも悪くないと提案される。再び京都へやってきた鴨は、「上羽や」に客として泊まり、接客や内装や帳簿などをチェック。翌日、衣川に経営再生のための追加融資を依頼した。「上羽や」に戻り、従業員を集めると大幅な改革案を発表する。守り通してきた最上級のおもてなしを根底からくつがえす提案にあ然とする従業員たちに、鴨はその通りに営業するように一方的に告げる。

上羽鴨（松下奈緒）の強引な改革案は失敗に終わり、従業員全員が辞めてしまった。鴨は衣川周平（椎名桔平）の提案にのり「上羽や」売却を決める。その矢先、会合のため京都に来ていた財務大臣の仲代公吉（松平健）が「上羽や」にやってきた。常連だった仲代は、先代女将・薫（市毛良枝）をしのび宿泊したいと言い、いつも通りのもてなしをして欲しいと告げて会合に出かける。困った鴨は売却をネタに衣川に風呂掃除をさせる。さらに、ぬか床を心配して厨房に来ていた寺石秀（高杉亘）を発見し、夕食を作るように依頼。寺石は指定した京野菜を揃えられたら料理を作ると約束をする。柴田優梨愛（岡本あずさ）はそんな鴨と寺石のやりとりを聞き、すぐに間山紗江（堀内敬子）ら仲居たちに報告をする。同じ頃、塩見鞠子（かたせ梨乃）は「ワイズ・コンサルティング」の高瀬裕次郎（伊武雅刀）に呼び出され「上羽や」売却成立後の女将になって欲しいと打診されていた。デパ地下で食材を買いそろえた鴨だが、寺石はこの野菜ではできないと突っぱねる。鴨はかつて取り引きしていた青果店に行き、なんとかいくつかの野菜は購入するが、タケノコは品切れだと言う。タケノコだけが見つからず途方に暮れていると鞠子から電話が入った・・・。

「上羽や」売却は止めると言い出した上羽鴨（松下奈緒）だが、従業員は誰も戻ってこない。鴨が東京へ帰っている間に峰岸鼓太郎（笹野高史）が週末に2組の予約を受けてしまう。呆れる鴨だが、営業再開を決意。ぬか床を心配して厨房に来た寺石秀（高杉亘）をつかまえ料理をお願いし、腰を痛めた峰岸の代わりに衣川周平（椎名桔平）と加茂京介（大東駿介）に男衆の仕事を押し付ける。さらに職探しをしていた間山紗江（堀内敬子）らの元へ行き、再び「上羽や」で働かないかと声をかける。まず謝罪をするべきだと訴える紗江たちに、鴨はそれなら別を当たるとあっさり去る。「梅垣屋」に行き梅垣鈴風（若村麻由美）に協力を求めるが、週末は無理だという。そこで塩見鞠子（かたせ梨乃）と遭遇した鴨は、戻ってこないかと声をかけた。すぐに断った鞠子だが、今夜来る客が安永真知子（江波杏子）だと聞き、1日だけという条件で「上羽や」に戻る。もう1組の母子、母の大場夏美（いしのようこ）と退屈そうにしている娘の大場弓香（美山加恋）は鴨が仲居として接客することに。金魚の世話のために「上羽や」に来た柴田優梨愛（岡本あずさ）は、鞠子を目撃し紗江たちに報告。紗江たちは、様子を見るために「上羽や」へこっそりやってくる。安永を接客している鞠子を見て驚く紗江たち。さらに仲居として働いているものの、まったく仕事ができていない鴨を見て呆れる。そんな鴨の前にウェーバー伯爵が現れ・・・。

「上羽や」の女将になった上羽鴨（松下奈緒）は、塩見鞠子（かたせ梨乃）から仲居たちの下について仕事を学ぶように言われるが、なにひとつ満足にできずに怒られてばかり。ある日、仕入れ業者たちが月末払いの請求書を置いていく。「ワイズ・コンサルティング」への返済日も月末で、頭を抱える鴨。仲居たちが給料が出ないなら辞めると話しているのを聞き、信頼を得るために従業員と業者への支払いを優先することを決める。そんな中、衣川周平（椎名桔平）と高瀬裕次郎（伊武雅刀）が客としてやってきた。鴨が支払いできないと予想し、「上羽や」がなくなる前に泊まろうとやってきたのだ。衣川を部屋に案内した時に支払い延期をお願いしようとしていた鴨だが、ここぞとばかりに大きな態度をとる衣川に腹を立て何も言わず部屋を出る。 同じ頃、間山紗江（堀内敬子）は予約客の稲川純一（菅原大吉）と織田睦夫（木下ほうか）を部屋に案内していた。予約は3名だったことを確認すると、もうそろっているから夕食は3人分用意して欲しいと言う。夕食ができあがり、鴨が紗江と一緒に運んでいくことになった。紗江が何も言わず3人分のお酌をすることに釈然としない鴨。やがて稲川は高校時代に撮った自分と織田ともう1人が写った写真を取り出し、3人目の席に置く。高校卒業時に30年後に「上羽や」に行くことを約束したという話を聞いた鴨は、もう1人が遅れて来るなら作り直すと1人分の料理を片付けようとして紗江に止められる。

衣川周平（椎名桔平）がコンサルタントとして「上羽や」の支配人になると言い出した。先日、「上羽や」に上司の高瀬裕次郎（伊武雅刀）と宿泊した際、絵画や掛け軸、壺などの美術品が名だたる作家によるものばかりで、「上羽や」は考えていた以上にお宝が眠っていることに気づいた、という。それを調べるためにも衣川は支配人を名乗り出たのだった。衣川は従業員の取りまとめをし、彼らからの信頼も得ている様子で、上羽鴨（松下奈緒）は面白くない。 そんな時、鴨の財務省の恋人、石黒哲也（丸山智己）が京都まで訪ねてくる。「上羽や」内でも鴨スケのエリート恋人がやってきた、と噂話に花が咲く。そこへ、予約していたお客がやってきた。セリィという人気ファッションブランドの社長夫妻だけに、粗相がないよう仲居たちも気を引き締める。社長の望月啓志（神尾佑）はすぐに仕事に出てしまったが、残った社長夫人の幸子（高岡早紀）は、旅館内の絵画や掛け軸にケチをつけ、飲み物や夕食に使う食材から、アロママッサージのアロマオイルの銘柄まで指定してくる始末。鴨はモンスターカスタマーだと怒るが、塩見鞠子（かたせ梨乃）や間山紗江（堀内敬子）は、お客様の要望に応えるのが務めと、鴨にアロマオイルのおつかいを指示する。 ブツブツ文句を言いながら、鴨は石黒を連れて京都の街へ。石黒は「2人でデートできるからいいじゃないか」となだめる。さらに、鴨に「大事な話がある」と切り出し・・・。

鴨（松下奈緒）は、亡き母、薫（市毛良枝）の納骨式に出席、鞠子（かたせ梨乃）や寺石（高杉亘）らも参列していた。その頃、上羽やでは、峰岸鼓太郎（笹野高史）が客間の掛け軸をかけていた。先々代の女将に仕えていた勘兵衛（山谷初男）という番頭が買ったもので、骨董を見極める眼力のある人だった、と衣川周平（椎名桔平）に話す峰岸。 「上羽や」近くでは、骨董店に空き巣が入った、という騒動が起きる。すると、サングラスにマスクの怪しい男（佐戸井けん太）が、突然、「上羽や」に泊まりたい、とやってくる。経営上、お客様を選り好みできる状況ではない、と紗江（堀内敬子）に豪語したばかりの鴨は、ヤマダと名乗るその客を受け入れるが、ヤマダは「僕がここに泊まっていることは秘密にしてほしい」と頼む。鴨はヤマダが空き巣犯ではないかと疑い、警察に通報した方がいいのでは、と言い出すが、1度迎えたお客様を泥棒扱いするなんて、と鞠子から一喝される。悔しさを噛みしめていると、そこへ宿泊客の兄弟、タケル（椙杜翔馬）とサトル（溝口怜冴）がやってきて、「これ、貸してやる」と、鴨にあるマンガ雑誌を渡した。 翌日、梅垣鈴風（若村麻由美）の案内のもと、鴨が呉服展示会を見ていると、「上羽や」から刑事がヤマダを探してやってきた、という連絡が入り、急きょ旅館に戻る。すると、刑事だと勘違いしていた久保という男（石橋保）は、『少年ダッシュ』という有名マンガ雑誌の編集者だった。