カウンターパート／暗躍する分身

国連諜報機関の情報伝達部で働くハワードは、戦略部のクエイルから協力を依頼されるが、目の前に現れたのは自分とそっくりの男だった。これをきかっけに、ハワードは自分の世界と全く同じ世界がもう一つ存在していることを知る。もう一人のハワードによると、向こう側からやって来た殺し屋ボールドウィンが妻エミリーの命を狙っているという・・・。

自分の世界に戻った別ハワードは、向こう側の別エミリー率いる引き渡しチームに拘束されるが、全員を殺して脱出する。犠牲者が出たことで上司から注意を受けたが、別エミリーには身に覚えがなく、誰かが別ハワードの命を狙っており、その動きに自分が巻き込まれていることを知る。一方、別ハワードはボールドウィンの手掛かりをつかみ、再度別世界へやって来る。

こちら側の警察に拘留されたボールドウィンを巡って、両世界の外交部が動き始めた。向こう側は一刻も早いボールドウィンの奪還を、こちら側はボールドウィンと引き換えに価値ある情報を手に入れようと躍起だ。その間、ボールドウィンから黒幕の情報を引き出すべく、クエイルは義理の父で外交官であるファンチャーに、別ハワードは別世界の大使ランベールに交渉の引き延ばしを持ちかける。

渡航ビザを取り上げられた別ハワードは、自分の代わりにハワードを向こう側へ送る。二人のハワードの入れ替わりが無事に完了したが、別ハワードの娘アンナの登場で事態が一変。薬の過剰摂取で入院した別エミリーのもとへ連れていかれる。

クエイルとアルドリッチは戦略部に潜り込んでいるスパイを特定すべく、向こう側から亡命してきたアリスを頼る。そこで二人はインディゴと呼ばれる「学校」の存在を知る。選ばれた子供たちを訓練し、将来こちら側に送り込むスパイとして養成していたのだ。一方ハワードは、別エミリーと協力して大使館の特使エドガーからポツダムにある家の存在を聞き出す。

別エミリーとハワードが何やら探っていることを知ったイアンは、ハワードを怪しみ嘘発見器にかけるが、別エミリーに阻まれる。一方こちら側では、戦略部のスパイ捜しの最中、別ハワードは自分にスパイの情報を流したハインリッヒが殺されたことを知る。別ハワードは、ある人物から情報が漏れていることに気づく・・・。