지구가 탄생하던 때부터 존재했던 바이러스가 지구에서 인류를 몰아내기 위해 지성체 우카카를 만들어낸다. 이에 맞서 항바이러스 체질의 나노전사 로카파 영웅들이 인류를 구하러 나선다.