어느 날, 우연히 떨어진 노트를 주운 미사는 사신 렘과 위험한 계약을 하고, 수사팀에 합류한 라이토는 L과 서로의 내막을 알아내려 고군분투한다. 그러던 중, 제2의 키라가 나타나고 이름이 적힌 자들은 곧 죽음에 이르는 데스노트를 둘러싼 예측할 수 없는 이야기가 펼쳐진다.