사망 후 되살아난 자들을 '아인'이라 부르며 감시하고 잔혹한 생체 실험을 진행해온 정부 연구소가 의문의 아인에게 공격당한다. 평범한 학생이었지만 아인이 되어 통제당하던 케이는 그 틈을 타 홀연히 사라진다. 정부에 복수하기 위해 전국의 아인들을 모아 테러를 계획하던 사토와 이를 막아야만 하는 케이의 전쟁이 시작된다.