CIA는 자체적으로 개발한 템플이라는 인공지능이 탑재된 심문 장소를 전 세계에 비밀리에 건설한다. 이들 중 하나인 9구역의 요원들이 연락 두절 상태가 되자, 상황 파악을 위해 아이작이 파견된다. 아이작은 템플 시스템을 설계한 가브리엘을 데리고 9구역으로 향하고, 그곳의 요원들이 잔인하게 살해됐다는 것을 알게 된다. 하지만 아이작, 가브리엘과 부하들은 9구역에 갇히게 되고, 알 수 없는 존재의 공격을 받게 된다.