폐쇄된 쥬라기 공원을 보존하기 위해 해먼드는 말콤 박사를 동원해 조사팀을 만들게 된다. 그의 의뢰를 받은 말콤 박사는 다시 공룡들의 섬으로 향한다. 섬을 탐험하던 중 말콤 박사는 해먼드의 어두운 본심을 알게 되고 포획되어있는 공룡들을 모두 풀어주다가 위험에 처하게 된다. 한편, 해먼드의 지시대로 티렉스가 인간들의 세계로 오게 되고 통제가 불가능한 위험한 존재는 사람들을 공격하기 시작한다.