화성에서 발견된 판도라 박스가 가동되자, 스카이 월이라는 벽이 나타나 일본을 셋으로 나누어 버린다. 동도, 서도, 북도로 나뉜 일본은 서로 싸우기 시작하고, 동도에서는 스매시라는 난폭한 생명체가 출몰하기 시작한다. 동도 정부는 물리학자 키류 센토를 파견하고, 그는 가면라이더 빌드가 되어 사람들을 구하려 한다.