돌아가신 어머니를 되살리기 위해 에드워드와 알폰스 엘릭 형제는 금기를 깨고 인체 연성을 시도한다. 하지만 그 대가로 에드는 왼쪽 다리를, 알은 온몸을 잃게 된다. 에드는 자신의 오른팔을 대가로 알의 영혼을 갑옷에 담는 데 성공하고, 잃어버린 팔과 다리 대신 철로 된 의수를 얻게 된다. 자신의 사지와 알의 몸을 되찾는 방법을 찾던 에드는 국가 연금술사가 되어 강철의 연금술사라는 호칭을 얻고, 엄청난 힘을 가진 현자의 돌을 찾아나선다.
에피소드 1
센트럴에 온 에드는 ‘빙결의 연금술사’를 체포하라는 임무를 받는다. 그는 이슈발 섬멸전의 실체를 알고 브래들리 대총통을 없애려 하는 전직 국가 연금술사 아이작 맥도걸. 에드는 아이작이 현자의 돌을 갖고 있는 게 아닌지 의심하지만 알아내지 못하고, 결국 아이작은 브래들리 대총통에게 당하고 만다.
에피소드 2
시작의 날
지금으로부터 4년 전, 형제는 어린 시절 돌아가신 엄마를 되살리기 위해 인체연성을 시도한다. 하지만 그 대가는 너무나도 가혹해서 에드는 왼쪽 다리를, 알은 몸 전체를 빼앗기고 만다. 진리를 본 에드는 다시 오른팔을 희생하여 알의 영혼을 갑옷에 정착시키고, 오토메일을 달고 국가 연금술사 자격을 취득한다.
에피소드 3
거짓된 종교
리올에 도착한 에드와 알은 연금술이 생소한 사람들에게서 태양신 레트를 섬기는 코넬로 교주에 대해 듣게 된다. 코넬로의 기적이 연금술이라는 것을 확인한 에드와 알은 그가 현자의 돌을 사용하는 게 아닌가 의심한다. 레트쿄의 신봉자인 로제를 만난 에드와 알은 그녀를 통해 코넬로에게 접근하고, 로제는 자신의 애인을 되살려 준다던 코넬로의 실체를 알게 된다.
에피소드 4
연금술사의 고뇌
철혈의 연금술사 바스크 글렌은 국가 연금술사만 노린다는 의문의 인물에게 살해당한다. 센트럴로 돌아온 엘릭 형제는 로이 머스탱의 소개로 키메라 연성을 연구하는 철명의 연금술사 쇼 터커를 만나게 된다. 매일 터커의 집에서 자료를 연구하던 에드와 알은 터커의 딸 니나와 친해지게 된다. 한편, 다가오는 평가일에 부담을 느낀 터커는 새로운 키메라를 연성하려 한다.
에피소드 5
슬픈 비
코넬로 교주를 사칭하여 리올에 폭동을 일으킨 엔비는 러스트, 글러트니와 함께 그들의 제물을 죽이고 다니는 스카를 제거하려 한다. 한편, 니나의 죽음으로 고통스러워하던 에드와 알은 갑자기 나타난 스카의 공격을 받게 되고, 엄청난 힘을 가진 그에 의해 궁지에 몰리게 된다.
에피소드 6
희망의 길
에드워드와 알은 망가진 기계 갑옷을 고치기 위해 고향 리젬블로 향하던 중, 이슈발 전쟁 이후 사라진 전 국가 연금술사 마르코 박사를 만난다. 에드워드는 의술에 연금술을 접목하려 한 그로부터 인체 연성과 현자의 돌에 관한 정보를 얻고자 한다.
구기야마 리에
타카모토 메구미
아소 미요코
박로미
미키 신이치로
오리카사 후미코
미즈키 나나
토요구치 메구미
오키아유 료타로
이리에 야스히로
후쿠나가 겐
