돌아가신 어머니를 되살리기 위해 에드워드와 알폰스 엘릭 형제는 금기를 깨고 인체 연성을 시도한다. 하지만 그 대가로 에드는 왼쪽 다리를, 알은 온몸을 잃게 된다. 에드는 자신의 오른팔을 대가로 알의 영혼을 갑옷에 담는 데 성공하고, 잃어버린 팔과 다리 대신 철로 된 의수를 얻게 된다. 자신의 사지와 알의 몸을 되찾는 방법을 찾던 에드는 국가 연금술사가 되어 강철의 연금술사라는 호칭을 얻고, 엄청난 힘을 가진 현자의 돌을 찾아나선다.