지구 방위군 한국 지부의 로봇 부대 「스토리지」의 파일럿이 된 강태우. "그 이름은 울트라맨 제트!!." 흉폭우주상어 게네가그의 공격 으로 궁지에 빠진 그들이 하나가 될 때, 새로운 울트라의 이야기가 시작된다!"

대괴수 로봇 부대 「스토리지」의 새로운 미션. 그것은 전기를 먹이로 투명한 형태로 사라지는 투명괴수 네롱가의 토벌이다. 괴수를 쓰러뜨리기 위한 새로운 작전을 계획한다! 과연 강태우는, 그리고 울트라맨 제트는이 난적을 공략 할 수 있을까?

터널 공사를 예정하고 있던 산에, 동면상태로 고대괴수 고모라가 잠들었다. 꽃가루 때문에 갑자기 동면상태에서 깨어나버린 고모라가 날뛰기 시작한다! 강력한 신체능력으로 다가오는 고모라에게, 크게 고전하는 울트라맨 제트 이지만, 마침 새로운 힘이 생각치도 않게 날아들고...

마침내 대괴수 로봇 부대·스토리지의 새로운 전력, 특공기 2호 윈담이 완성된다. 그러나 에너지 충전문제로 윈담은 출동하지 못한다. 이런 가운데, 지저괴수 테레스돈이 지상에서 날뛰기 시작한다! 스토리지!, 그리고 울트라맨 제트는 과연 이 위기를 극복할 수 있을까!