해수욕객으로 붐비는 바다의 집 '레몬'을 운영하는 아사자와 자매. 그런 바쁜 와중에 둘째 딸 에이코 앞에 이상한 차림의 소녀가 나타난다. 자신을 '오징어 소녀'라고 소개하는 그 소녀는 인류를 침공하기 위해 온 바다의 사자라고 주장하는데.../ 바다의 집 레몬에서 아르바이트를 하게 된 오징어 소녀. 혹사당해 의기소침해진 그녀 뒤에서 다가오는 그림자. 뒤를 돌아보니, 호기심으로 빛나는 소년의 모습이…/ 비가 와서 한산해진 레몬. 추위에 재채기를 한 오징어 소녀의 입에서 뿜어진 검은 액체를 장녀 치즈루가 뒤집어쓴다. 인간이 오징어 먹물을 스파게티에 섞어 먹는다는 것을 알게 된 오징어 소녀는...

촉수에 쥐가 나서 물에서 허우적대는 오징어 소녀를 라이프 세이버 고로가 구해 준다. 라이프 세이버는 바다를 지키는 거라는 말을 듣고 친근감을 느낀 오징어 소녀였지만, 그의 실제 일은 인류 정복을 노리는 오징어 소녀가 상상하던 것과 달랐다. 일을 방해하려는 오징어 소녀를 귀찮아하는 고로에게, 복수를 계획하는 오징어 소녀에게 기회가 찾아오지만.../ 인간이 생일을 축하하는 것에 관심을 보인 오징어 소녀는 자신의 생일을 임의로 정해 생일 파티를 열어달라고 졸라대기 시작했다. 치즈루의 호의로 즉시 오징어 소녀의 생일 파티를 열기로 하고 준비에 착수하는 레몬 일행이지만, 그 모습을 본 오징어 소녀는...?/ 에이코의 동급생인 사나에가 애견 알렉스를 데리고 레몬에 놀러 온다. 에이코가 알렉스를 귀여워하는 모습에 질투를 느낀 오징어 소녀는 개와 동등한 대우를 요구하지만,의도와 다르게 치즈루가 오징어 소녀를 개를 다루듯이 가지고 논다. 그런 모습을 지켜보던 사나에는 오징어 소녀를 집으로 초대하는데...

무서움을 느끼지 못하는 오징어 소녀를 보고 에이코는 무덤가로 데려가 귀신을 보여 줘서 겁을 먹게 하고자 한다. 하지만 의도와 다르게 오징어 소녀는 전혀 무서움을 느끼지 못하는데... / 수영을 배우고자 하는 타케루와 함께 바다에 나온 오징어 소녀는 범고래, 상어, 바나나 튜브를 보고 자신의 천적이 돌아다닌다고 생각하여 두려움에 떠는데.../ 바다의 집 레몬에 새로운 알바생인 사이토 나기사가 들어온다. 나기사는 오징어 소녀를 보고 기겁하며 위협적인 존재라 생각한다. 그리고 자신을 보고 무서워하는 나기사를 보고 오징어 소녀는 희열을 느끼는데...

모래사장에서 지갑을 주운 오징어 소녀는 지갑 주인으로부터 답례로 1만 엔을 받는다. 돈의 가치를 전혀 모르는 오징어 소녀는 나기사와 함께 상점가로 쇼핑을 나가지만, 무엇을 사야 할지 몰라 어리둥절해진다. 결국 좋아하는 새우를 대량으로 사게 되지만, 두 사람의 쇼핑 모습을 뒤에서 사나에가 엿보고 있었는데... / 레몬의 영업 시간 종료 후, 오징어 소녀는 아이이자와 집에 함께 가고 싶었지만, 에이코에게 단호히 거부당한다. 어쩔 수 없이, 오징어 소녀는 레몬에서 TV를 보며 시간을 보내려 했지만 TV가 고장 나고 만다. 지루함을 달래기 위해 침공 놀이에 빠진 오징어 소녀는 가게의 비품을 가지고 놀다 사고를 치는데... / 옆 해변을 정찰하러 온 오징어 소녀와 에이코는 비키니 차림에 오징어 소녀 스타일의 머리를 쓴 짝퉁 오징어 소녀를 만나게 된다. 입에서 검은 액체를 흘리며 촉수까지 움직이는 그 짝퉁을 만든 것은 바다의 집 미나미카제의 점장이었다. 그는 진짜와 짝퉁을 교환해 달다려 내기를 제안하는데...

섹시한 비키니 차림에 금발을 휘날리는 미녀 신디. 그녀는 미국에서 우주인 출몰 정보를 얻고 온 듯하며, 오징어 소녀를 보자마자 우주인이라고 단정하고 연구소로 데려가려고 한다. 필사적으로 저항하는 오징어 소녀는 촉수와 오징어 먹물로 자신이 오징어임을 증명하려 하지만, 신디는 그 자체가 외계인의 증거라고 주장하는데…/ 여름방학 중 등교일, 에이코가 학교로 가려고 하자 오징어 소녀는 그곳이 어떤 곳인지 궁금해한다. 에이코는 무슨 일이 생길까 봐 오징어 소녀를 뜯어말리고 등교하지만, 학교에는 오징어 소녀가 나타난 것. 과학실, 가정실, 체육관 창고를 조사해 나가는 오징어 소녀는 학교가 인간의 군사 기지임을 확신하는데…/ 해변을 산책하던 에이코는 자그마한 울음소리를 듣는다. 파도 치는 해변을 보니 병 속에서 작은 생물이 허우적거리고 있는 것다. 에이코는 그 병과 작은 생물을 집으로 데려가는데...

히어로 쇼 행사장을 지나가던 오징어 소녀는 행사장을 가득 메운 아이들과 함께 쇼를 관람하게 된다. 검은 타이츠를 입은 무리가 아이들에게 공격을 시작하자 쇼의 주인공 가면 라이더가 등장한다. 요상한 모습의 히어로를 보고 배꼽을 잡는 오징어 소녀. 그런데 악당 보스인 오징어 마인이 등장하자 표정이 급변하는데…/ 수학 문제를 풀다가 어려워서 끙끙 앓는 에이코. 그런데 오징어 소녀가 문제의 답을 너무도 쉽게 맞히는 것이다. 오징어 소녀가 속임수를 썼다고 의심하는 에이코는 더 어려운 문제들을 내지만 모두 정답을 맞혀 버리는 것. 그래도 의심을 떨치지 못한 에이코는 최상위권 대학의 입시 문제를 오징어 소녀에게 내지만 그것마저도 술술 풀어 버리는데.../ 서핑 중 큰 파도에 휩쓸린 나기사를 고로가 구조해 낸다. 다음 날, 레몬에 찾아온 고로에게 나기사는 다시 한 번 구해 준 것에 대한 감사를 표하는데 그 모습을 보고 고로가 나기사에게 수작을 부린다고 오해한 오징어 소녀는 고로에게 나기사를 건드리지 말라고 으름장을 놓는다. 그런데 그걸 본 에이코는...