어떤 사건도 즉시 해결하며 명탐정으로 이름을 날렸던 고등학생 탐정, 나구모 케이치로! 하지만 그것도 10년도 더 지난 이야기다. 지금은 걸어다니는 종합병원이자 스마트폰도 모르는 시대에 뒤떨어진 아저씨일 뿐. 그러던 어느 날, 조수가 되고 싶다며 나구모 탐정 사무소에 마시로라는 여고생이 들이닥쳤다. 그런데 이 여고생, 뭔가 범상치 않은데...

마시로의 같은 반 친구인 하야시다의 의뢰에 속옷 도둑의 진범 찾기, 그리고 연쇄 방화범인 니트맨의 테러 저지까지 다산다난한 나날 속에 상큼발랄한(?) 조수, 마시로와 함께 짜릿한 의뢰를 해결해 가는 나구모 케이치로. 해결하지 못할 것 같은 절체절명의 순간에 보여 주는 귀신 잡는 해병..., 아니, 마시로의 활약은?

집세 체납 독촉장을 받게 된 나구모. 돈이 궁한 나구모에게 안경 쓴 고등학생 명탐정, 아스나로 유가 조수로 고용해 달라며 찾아왔다. 심지어 돈을 받는 게 아니라 수업료를 내겠다고 하는 아스나로. 솔깃해하는 나구모를 본 마시로는 위기감에 아스나로에게 대결을 청한다. 그런데 이 고등학생 명탐정, 뭔가 정상이 아닌 듯한데...

쿠로이 야스오라는 어느 자산가의 만찬회 초대장을 받은 나구모. 마시로와 함께 도착한 절규관에는 다양한 사람들이 먼저 도착해 있었다. 저택이 외딴곳에 위치한 만큼 유일한 외부와의 통로인 현수교. 그런데 그런 현수교가 모종의 원인으로 무너지고 만다. 과연 이 수상한 저택의 비밀은?

열심히 돈을 모아 도청기 탐지기를 마련한 마시로. 아래층에 도청기가 설치됐단 걸 알게 된 마시로가 나구모와 함께 아래층으로 내려가 초인종을 누르자 그물 함정이 펼쳐지며 자칭 '사이언스 에이전트'이자 그 집 주인인 호시노 아즈하가 나타나는데... 간 수치가 걱정되는 관대한 어른, 나구모와 미성년자라서 맥주 대신 보리차를 고래처럼 마시는 마시로의 이번 사건은?

TV에 나오는 여자 모임을 보고 마시로도 여자 모임을 열기로 한다. 그 모임에 참석하게 되며 첫 만남을 가지게 된 마키와 아즈하. 그러나 마키는 범접할 수 없는 독특함에 아즈하가 몹시 불편하다. 같은 시각, 나구모와 아스나로, 네즈도 모임을 갖게 됐는데 아스나로와 네즈는 지난 스토킹 사건으로 서로 으르렁거린다. 사우나가 취미인 나구모와 물건 깨부수기 달인인 마시로가 함께하는 이번의 이야기는?