Scrats hilarische jacht op zijn vervloekte eikel, die hij sinds het begin der tijden achternazit, heeft drastische gevolgen voor de planeet: een continentale ramp die de aanleiding is tot het grootste avontuur ooit voor Manny, Diego en Sid. In de nasleep van die opschudding wordt Sid verenigd met zijn chagrijnige oma en wordt de kudde geconfronteerd met een bende piraten die vastbesloten is hun terugkeer naar huis te verhinderen.