Wanneer het CBI-team naar een badplaats afreist om de moord op een politiechef te onderzoeken, komt Lisbon haar broer Tommy tegen, een premiejager, die op zoek is naar een voortvluchtige.
Na 16 jaar in de gevangenis wordt een veroordeelde verkrachter (gastster Henry Thomas) vrijgesproken dankzij nieuw getest DNA-bewijs.
Courtney Whitmore ontdekt een geheim in de eerste aflevering van de serie.
Henry Jr. werkt aan zijn nieuwe vaardigheden. Geheimen uit het verleden van zijn familie dwingen hem tot een moeilijke beslissing. Spanningen tussen Pat en Barbara brengen herinneringen bij haar naar boven.
Terwijl de ISA hen op de hielen zit komen Courtney, Pat en het team samen om hun volgende stap te bespreken. Rick heeft een doorbraak en het team bereidt zich voor op een confrontatie met de ISA.