Cuando Aku renace para dar inicio a su reino del terror, el hijo del Emperador es enviado lejos para entrenarse como samurái. Ese niño se convierte en hombre y trata de matar a Aku con su poderosa espada, pero él lo destierra al futuro.
El samurái aterriza en el futuro y le dan el nombre de Jack. Una raza de perros lo recluta para destruir a Aku.
Jack se provee de armas y vence al ejército de escarabajos-robot de Aku, logrando así salvar a la raza canina.
Jack ayuda a liberar a los Woolies de los tiránicos Chritchellites.
Cuando Jack por error frustra la posibilidad de un grupo de científicos de escapar de Aku, él y estos hombres de ciencia unen sus fuerzas para intentar remediar la situación y enviar a Jack de vuelta a su tiempo.
Aku adopta la forma de una mujer a fin de evitar que Jack regrese al pasado para destruirlo.
Phil LaMarr
Samurai Jack
Grey Griffin
Voz
John DiMaggio
Mako