U.C. 0096. Três anos após a Rebelião de Char, Banagher Links é um garoto que vive em Industrial 7, uma colônia de manufatura. Ele encontra uma misteriosa garota chamada Audrey Burne, que diz estar tentando impedir que a Fundação Vist entregue a Caixa de Laplace para os dissidentes de Neo Zeon, hoje conhecidos como os Mangas. Ciente de que isto poderia acarretar em outra guerra, Banagher decide ajudá-la. Logo, a colônia torna-se um campo de batalha entre os Mangas e as Forças da Federação Terrestre, que também tenta impedir o conflito.