Ittoki es un joven corriente que lleva una vida normal. De repente, una chica que no conoce de nada se le declara en el instituto.

Tras el intento de asesinato, Ittoki descubre toda la verdad: su familia lidera un clan ninja. Para evitar más problemas, Ittoki deberá ir a la Academia Ninja.

Comienza la nueva vida escolar de Ittoki. Aunque las novedades le gustan mucho, tendrá que hacer frente a los chicos del clan Koga.

En este episodio centrado en las herramientas ninja, tanto Ittoki como Tokisada tendrán que usarlas para cumplir sus objetivos.

Se acerca el examen final, donde Ittoki tendrá que resistir el ataque incesante por parte de los ninjas de Koga.

Ittoki se quedará en la mansión de los Iga durante las vacaciones, acompañado de Kosetsu, Ryoko y Kirei. Esos días pueden suponer un cambio muy importante.