Elitteamet BAU, bestående av gärningsmannaprofilerare inom FBI, kämpar för att analysera de mest förvridna kriminella hjärnorna i landet för att förutsäga deras nästa drag, innan de mördar igen.
När en värmebölja slår till mot Oahu skuter mängden brott i höjden, vilket tvingar McGarrett och Danny att ge sig efter en banktjuv, medan Tani och Junios bil stjäls under ett arbetspass.
När ett militärplan skjuts ned i Bosnien måste Team Scorpion hjälpa till att återskapa dess stealth-teknik innan den hamnar i fiendens händer.
Magnum och Higgins är fast på öppet hav efter att ha blivit kapade på sin yacht. Duon måste nå land innan Higgins förblöder av skottskadan han fick under tumultet, eller kaparna återvänder.
När den fjärde juli ser sin gryning så förbereder sig cellen för att starta två samordnade bombattacker.