Reese och Finch måste rädda en lovande ung läkare.
I nutida New York har Joan Watson anlitats för att se till att detektiven Holmes inte får ett återfall. Hon slår följe med honom när han utreder ett mystiskt mord på en läkares fru.
Holmes och Watson samarbetar med Holmes far, Morland (John Noble), för att anlita hans enorma kriminella nätverk för att montera ner teknikmiljardären Odin Reichenbachs brottsförebyggande system.
Frank sätter hela NYPD i rörelse för att få fast den mördare som dödade en tjänstledig polis under en diamantkupp.
Alicia tvingas möta sin före detta chef, Jonas Stern, i domstolen och debatterar i rättsfallet införlivandet av personuppgifter. Under tiden fortsätter Peter att utforska religion i sitt försök att göra comeback.