小新一行人在風間的邀請下,來到了住宿制的菁英學校「天下春日部學院」進行為期一週的體驗入學，小新一行人則對住宿生活懷著期待的心情。而風間打算在體驗入學期間拿下好成績，並正式就讀。可是，小新一直扯他的後腿，兩人大吵一架後風間憤而跑出宿舍。小新一行人外出尋找風間，最後在崩塌的鐘樓中找到了倒臥其中的風間！而且他的屁股上有個詭異的咬痕…。隔天早上，風間醒來後居然變成一個超級大笨蛋！原來在這間學院中，頻繁發生被神秘「咬屁鬼」咬過屁股的學生變成幼稚小鬼的奇妙事件！為了解開真相，小新一行人結成了「春日部偵探俱樂部」。小新一行人的奇妙推理會發生什麼事呢？