Peter Stormare

Wegen des Ausbruchs sind Pope und Bellick gezwungen, vor einem Untersuchungsausschuss zu den Vorkommnissen Stellung zu nehmen. Dabei sagt der ehemaligen Wärter Geary aus, dass Bellick von Abruzzi für gewisse Annehmlichkeiten geschmiert wurde. Als Bellick daraufhin sofort gekündigt wird, nimmt Direktor Pope aus Loyalität ebenfalls seinen Hut. Währenddessen kämpft Dr. Gudat weiterhin um die Hand von T-Bag, ohne zu ahnen, wie tödlich diese Operation enden könnte. C-Note, Abruzzi und Sucre gehen ihre eigenen Wege, nachdem Michael ihnen etwas Startkapital gegeben hat. Eigentlich sollten Michael und Lincoln sich auch auf den Weg nach Utah machen, doch Lincoln lässt es keine Ruhe, dass sein Sohn L.J. in ein Erwachsenen-Gefängnis nach Arizona gebracht werden soll. Er überredet Michael, ihm bei der Befreiung L.J.s behilflich zu sein. Die beiden ahnen nicht, dass FBI-Agent Mahone genau diese Reaktion vorhergesehen hat, und die beiden Flüchtlinge erwartet.

Nach ihrer geglückten Flucht werden Michael, Lincoln und die anderen nicht nur von Bellick und Direktor Popes Zorn verfolgt, sondern auch von dem merkwürdigen FBI-Agenten Mahone, der sich wie ein Profiler in Michael hineindenkt und dem Flüchtigen immer einen Schritt voraus zu sein scheint. Unterdessen entscheidet sich Sara nach ihrer Überdosis am Scheideweg zwischen Leben und Tod ganz eindeutig für das Leben, fühlt sich aber immer noch von Michael verraten und verkauft. Und während Michael sein Genie ein weiteres Mal unter Beweis stellt, weil er sich nicht allein auf Abruzzis Jet verlassen hat, sondern auch noch einen Plan B vorbereitet hat, mit dem sie aus eigener Kraft die Flucht nach Mexiko schaffen könnten, überredet Veronica den angeblich ermordeten Terrence Steadman dazu, wieder ins Leben zurückzukehren. Doch ihr anschließender Anruf bei der Polizei erweist sich als geradezu tödlicher Fehler ...

Kaum denken Lincoln und Michael, sie seien vorerst in Sicherheit, werden sie zusammen mit Nika von Bellick und Geary gejagt und gefangen genommen.Denen geht es nun nicht mehr um die ausgesetzte Belohnung, sondern um Westmorelands versteckte Millionen. Unterdessen wird T-Bag, der sich dank seiner verwundeten Hand auf seiner Flucht erfolgreich als Kriegsveteran ausgibt, von einem Autofahrer mitgenommen, der mit seiner 14-jährigen Tochter nach Utah unterwegs ist. T-Bag kann nicht widerstehen und macht sich an das Mädchen heran, was diese natürlich sofort ihrem Vater erzählt. Abruzzi sieht endlich seine Familie wieder, entscheidet sich aber gegen den Rat seiner Frau dafür, seine Freiheit wieder zu riskieren, um sich an Fibanacci zu rächen, der angeblich in Washington in einem Motel sitzt. Auch Tweener sitzt in einem Motel, zusammen mit der nervösen Studentin Debra Jean, die er als Mitfahrer nach Utah begleitet und die unbedingt eine Pause auf dem Weg nach Utah machen will. Und während Kellerman sich als angeblicher Junkie an Sara in deren Drogenentzugsgruppe heranmacht, erfährt FBI-Agent Mahone, dass einer der Ausbrecher in einem Motel Unterschlupf gefunden hat.

Nach einem 'Verbindungs-Ritual' wird die Studentin Niki Shumaker tot aufgefunden. Bei der Obduktion stellt Megan erstaunt fest, dass Nikis Gehirn entfernt wurde - durch die Nase. Vor einigen Jahren gab es einen ähnlichen Fall. Der damalige Täter, Wilson Polley, sitzt nach wie vor im Gefängnis. Suchen die Ermittler einen Nachahmungstäter? Bald verdächtigen sie Wilsons Tochter Sophia: Möglicherweise sitzt ihr Vater unschuldig hinter Gittern. Doch dann flieht Wilson aus dem Knast.

Während eines Familienurlaubs auf Hawaii werden die zwei jugendlichen Töchter von US-Botschafter Reeves entführt.