É o Ano 0096 do Século Universal, quase um século após o Incidente de Laplace, que transformou a história de uma humanidade recém iniciada na colonização espacial. Banagher Links é um jovem nascido após a Guerra de Um Ano e para quem, como todos os de sua geração, a guerra é um pesadelo distante. Mas um encontro do destino pode ser o auspício de um novo e iminente conflito.

A misteriosa garota encontrada por Banagher diz querer impedir uma guerra iminente. Os dois seguem ao encontro da Fundação Viste, Cardeas Viste, com o intuito de impedi-lo de passar adiante o item capaz de fazer explodir o conflito.

Os neo-zeônicos Mangas atacam Viste furiosamente em busca da Caixa de LaPlace, e Banagher é envolvido no conflito, um presságio da guerra anunciada por Audrey. É quando surge o Gundam.

Banagher Links descobre a verdade sobre seu pai e se tornou o piloto do Unicorn Gundam. Mas a guerra iminente que envolve a caixa de Laplace ainda paira no ar.

Full Frontal entra em conflito com as Forças Terrestres e Banagher comandará o Unicorn novamente, enquanto Audrey é feita refém.

Banagher encontra Full Frontal frente a frente na fortaleza neozeônica. Na Federação, Audrey precisa da ajuda de Riddhe para conseguir impedir uma nova guerra.