FBI Agent Don will einen Serienvergewaltiger zur Strecke bringen, doch er hat keine handfeste Spur. Als sein Bruder, Mathematikgenie Charlie, eine Karte sieht, auf der die Fundorte der Opfer markiert sind, entwickelt er eine Gleichung, mit der es seiner Meinung nach möglich sein muss, die Basis des Täters zu errechnen - also seinen Wohnort. Dons skeptischer Chef Merrick lässt sich überreden, die im errechneten Gebiet wohnhaften Männer anhand ihrer DNS zu überprüfen. Doch keiner von ihnen ist der gesuchte Täter.Don wird der Fall entzogen.

L.A. wird von einer Bande Bankräuber terrorisiert, die schon 16 verschiedene Überfälle verübt haben und jedesmal mit mehr oder weniger großer Beute erfolgreich abgezogen sind. Charlie sagt den Ort ihres nächstes Überfalls voraus. Dort hoffen Don, Terry und David, die Bankräuber mit lockerer Hand einsacken zu können. Die Bankräuber sind auch bekannt als die Gentlemen-Gauner, da sie jedesmal gleich vorgehen, den Kassierer nicht mit einer Waffe bedrohen und höflich bleiben. Groß ist das Entsetzen des FBI, als diesmal alles aus dem Ruder läuft. Anscheinend haben die Bankräuber noch Unterstützung von vier weiteren Personen.

Als sich eine geheimnisvolle Seuche in L.A. ausbreitet, wird das FBI unter der Führung von Don eingeschaltet. Mit Hilfe der Gesundheitsbehörden stellen die Ermittler fest, dass es sich um den Erreger der Spanischen Grippe handelt. Die Spanische Grippe war eine Pandemie im Jahre 1918, die mehrere Millionen Opfer auf der Welt gefordert hat. An diesem Erregerwird in fünf verschiedenen Labors auf der Welt geforscht. Deswegen gibt es fünf verschiedene Stämme des Erregers. Da dieser Erreger als ausgestorben galt, schlussfolgert das FBI auf einen bio-terroristischen Anschlag.

Charlie findet die Leiche eines Studenten. Er macht sich große Vorwürfe, denn der Tote war noch wenige Tage zuvor bei ihm, um sich einen Rat einzuholen. Doch Charlie fällt auf, dass der junge Student zu weit weg aufgeschlagen ist, als dass der Sturz von der Brücke ein Selbstmord gewesen sein könnte. Er überzeugt Don, die Ermittlung aufzunehmen. Dabei stoßen sie auf eine ominöse Baufirma. Musste der Student sterben, weil er einem Pfusch auf die Spur gekommen war?

Emily, die kleine Tochter von Becky und Ethan Burdick, wird von zwei Clowns auf ihrem sechsten Geburtstag entführt. Schnell stellt Charlie fest, dass Ethan Burdick ein recht unbekannter Mathematiker ist, der sich mit einem der Millenniumsprobleme auseinandergesetzt hat. Auf dessen Lösung, der Bestätigung der Riemannschen Vermutung, ist ein Preisgeld von einer Million Dollar ausgesetzt. Charlie weist Don darauf hin, dass man mit Hilfe dieses Beweises einen Algorithmus basteln kann, auf dem die gesamte Internetverschlüsselung basiert, und die Entführer somit noch viel mehr Geld machen können.

Bei einer Reihe von Zugunglücken, die sich schnell als Anschläge herausstellen, findet das FBI eine Reihe von unlösbaren Bekennerschreiben. Der herbeigerufene Charlie kann den Code zwar nicht sofort knacken, erkennt aber eine Reihe von Auffälligkeiten in diesem Schreiben. Sutter, ein Angestellter des NTSB, des nationalen Verkehrssicherheitsbüros, erklärt, dass er und seine Leute mehrere Wochen für diese Erkenntnisse gebraucht haben, aber auch noch nicht weitergekommen sind. Don und seine Truppe stellt fest, dass der Saboteur versucht, alte spektakuläre Zugunglücke nachzustellen.