Con un gran entusiasmo y un optimismo a prueba de bombas, el temerario Gonzo interviene en su primer papel protagonista en Muppets from Space, una desternillante aventura extraterrestre sobre la búsqueda del pasado de Gonzo. En una búsqueda con su amigo Rizzo para encontrar a su familia real, Gonzo descubre que sus familiares perdidos desde hace mucho son en verdad alienígenas de otro planeta. Después de anunciar a los cuatro vientos en el programa de entrevistas de la señorita Peggy, “OVNIManía”, que él es una prueba viviente de que “no estamos solos en el universo”, Gonzo se convierte en el objetivo de un paranoico espía del gobierno, K. Edgar Singer (Jeffrey Tambor). Al final Gonzo no solo debe escapar del recinto Singer, sino decidir si se sube a la nave nodriza y se reúne con la familia que siempre ha querido o se queda en la Tierra con sus amigos a los que siempre ha conocido y querido.